医学动画基本适应于医学领域的每一个分支。动画制作医学动画结合人体形态学、物理学和生物学等学科基础上，利用高仿真三维动画技术设计的“虚拟人及人体器官”，为医学研究、教学与临床提供形象而逼真的模型，为疾病诊断、新药和新医疗手段的开发提供参考。具体使用在以下领域:
1.治疗机制
可以对病人的病变部位进行三维重建，动画公司然后计算病情的各种特征参数，根据此参数来确定治疗计划
2.病理分析，药理作用机制
可以利用医学动画技术进行病理分析，研究药理作用机制。
3.模拟手术方案
医学动画模拟的手术环境可以让医生在术前身临其境般真实地将整个手术过程按照预定的手术方案“ 预演”一遍，课件制作然后对模拟手术获得的数据加以分析，从而从中找出预定手术方案的不足可以加以改善，确保实际手术中更高的安全性。
4.医疗器械的作用机理做全方位的仿真演示，三维动画制作医学挂图，医学报告
5.医疗事故复原模拟
可以通过医学动画对手术过程进行具象、科学的动画还原，进行医疗事故复原模拟，从中找出问题和错误操作。
6.医学教科研课题类动画视频和人体类知识科学普及
医学动画能够逼真准确的呈现现实世界的对象，建筑漫游学生可以迅速掌握知识，提高技术水平，还能降低培训费用。